Eksplorasi Bakteri Endofit pada Tanaman Padi dari Kabupaten Aceh Besar

Muhammad Rafif, Alfizar Alfizar, Lukman Hakim

Abstract


Bakteri endofit merupakan bakteri yang menetap dalam jaringan tumbuhan tanpa menimbulkan infeksi pada tumbuhan yang dihuni tersebut. Bakteri endofit merupakan satu alternatif yang dapat digunakan sebagai agensia pengendali hayati terhadap patogen tumbuhan. Tujuan dari penelitian ini yaitu untuk mengetahui keberagaman bakteri endofit tanaman padi yang bersumber dari lokasi berbeda Kabupaten Aceh Besar. Penelitian ini besifat eksploratif dengan peubah yang diamati mencakupi seleksi bakteri endofit melalui uji hipersensitivitas, karakterisasi bakteri secara makroskopis dan mikroskopis. Hasil isolasi diperoleh 36 isolat bakteri. Dari 36 isolat bakteri yang didapatkan, 10 diantaranya bakteri endofit yang memiliki pertumbuhan koloni yang baik, 5 bakteri patogen, dan 21 bakteri non patogen, akan tetapi memiliki pertumbuhan yang lambat dan tidak digunakan.

Keywords


Bakteri endofit, keberagaman, pengendali hayati, eksploratif

Full Text:

PDF

References


Abdel-Hamid, M.S., A. F. Elbaz, A. A. Ragab, H. A. Hamza dan K. A. El Halafawy. 2010. Identification and Characterization of Azotobacter chroococcum Isolated from Some Egyptian Soils. Journal of Agricultural Chemistry and Biotechnology. 1(2): 93–104.

Bai, Y. Q., X. L. Xin, Y. Z. Lai, X. C. Zhang, G. J. Zhang, J. F. Liu dan Y. P., Xin. 2013. Isolation and Screening of Bacillus subtilis. Journal of Animal Science and Veterinary Medicine. 32: 24–31.

Danaatmadja, Y., S. Subandiyah, T. Joko, dan C.U. Sari, 2009. Isolasi dan Karakterisasi Ralstonia syzygii. Jurnal Perlindungan Tanaman Indonesia. 15(1): 7–12.

Di Fiori, S. dan M. Del Gallo 1995. Endophytic Bacteria: Their Possible Role in The Host Plant. In: Azospirillum VI and Related Microorganisms. Dalam I. Fendrik, M. Del Gallo, J. Vanderleyden, dan M. de Zamaroczy, (Eds.). Springer-Verlag, Berlin.

Francis, I., M. Holsters dan D. Vereecke. 2010. The Gram-positive Side of Plant–Microbe Interactions. Environmental Microbiology. 12(1): 1–12.

Govindappa, M., R.V. Ravishankar, dan S. Lokesh, 2011. Screening of Pseudomonas fluorescens Isolates for Biological Control of Macrophomina phaseolina Root-rot of Safflower. African Journal of Agricultural Research. 6(6): 625–626.

Hala, Y., dan A. Ali. 2019. Isolation and Characterization of Azotobacter from Neems Rhizosphere. Journal of Physics: Conference Series. 1244: 1–5.

Halmann, J., A. Guadth-Hallmann, W.F. Mahaffee dan J.W. Kloeper. 1997. Bacterial Endophytes in Agricultural Crops. Canadian Journal of Microbiology. 43: 895–914.

Hastuti, R.D., R. Saraswati, dan A.P. Sari. 2014. Keefektifan Mikroba Endofit dalam Memacu Pertumbuhan dan Mengendalikan Penyakit Hawar Pelepah Daun pada Padi Sawah. Jurnal Tanah dan Iklim. 8(2): 109–118.

Hidayatun, N., D.N. Susilowati dan K. Mulya. 2011. Identifikasi 26 Isolat Bakteri Endofitik dan Filosfer Padi dengan Analisis Sekuen16s RDNA. Berita Biologi. 10(4): 455– 461.

Jha, P., dan A. Kumar. 2009. Characterization of Novel Plant Growth Promoting Endophytic Bacterium Achromobacter xylosoxidans from Wheat Plant. Microbial Ecology. 58(1): 88–179.

Jumardin., Fathurrahman., I. Kadekoh dan Ete, A., 2018. Eksplorasi Mikroba Epifit, Endofit Dan Rizosfer Dari Berbagai Sumber Padi Gogo Di Kecamatan Kulawi Kabupaten Sigi. Jurnal Agrotech. 8(2): 73–78.

Macedo-Raygoza, G.M., B. Valdez-Salas., F.M. Prado., K.R. Prieto., L.F. Yamaguchi., M.J. Kato., B.B. Canto-Canché., M. Carrillo-Beltrán., P. Di Mascio., J.F. White dan M.J. Beltrán-García. 2019. Enterobacter cloacae, an Endophyte That Establishes a Nutrient-Transfer Symbiosis with Banana Plants and Protects Against the Black Sigatoka Pathogen. Frontiers in Microbiology. 10(804): 1–15.

Marwan, H., S. Nusifera dan S. Mulyati. 2021. Potensi Bakteri Endofit sebagai Agens Hayati untuk Mengendalikan Penyakit Blas pada Tanaman Padi. Jurnal Ilmu Pertanian Indonesia. 26(3): 328–333.

Mitra, D., A.K. Mondal., S. Acharya dan A. Mukhopadhyay. 2014. Isolation and Characterization of Some Intracellular Pigmented Bacteria from Soil and Coal Powder. Research Journal of Biotechnology. 5(6): 24–32.

Mohamad, N.M., Jusoh, N.A., Htike, Z.Z., dan Win, S.L., 2014. Bacteria Identification from Microscopic Morphology: A Survey. International Journal on Soft Computing, Artificial Intelligence and Applications (IJSCAI). 3(2): 1–12.

Munif, A., S. Wiyono and Suwarno. 2012. Isolasi Bakteri Endoft Asal Padi Gogo dan Potensinya sebagai Agens Biokontrol dan Pemacu Pertumbuhan. Jurnal Fitopatologi Indonesia. 8(3): 57–64.

PHE (Public Health England). 2015. Identification of Pseudomonas species and other NonGlucose Fermenters. Public Health England, London.

Putri, M.H, Sukini. dan Yodong. 2017. Mikrobiologi. Kementerian Kesehatan Republik Indonesia, Jakarta.

Ramesh, C., N.V. Vinithkumar., Kirubagaran, R., C.K. Venil dan L. Dufossé. 2019. Multifaceted Applications of Microbial Pigments: Current Knowledge, Challenges and Future Directions for Public Health Implications. Microorganisms. 7 (7): 186.

Reyna-Flores, F., H. Barrios-Camacho., E. Dantán-González., J.A. Ramírez-Trujillo., L.F.L.A. Beltrán., N. Rodríguez-Medina., U. GarzaRamos dan R. Suárez-Rodríguez. 2018. Draft Genome Sequences of Endophytic Isolates of Klebsiella variicola and Klebsiella pneumoniae Obtained from The Same Sugarcane Plant. Genome Announcements. 6(12): 1–2.

Sabbathini, G.C., S. Pujiyanto., Wijanarka. dan Lisdiyanti, P., 2017. Isolasi dan Identifikasi Bakteri Genus Sphingomonas dari Daun Padi (Oryza sativa) di Area Persawahan Cibinong. Jurnal Biologi. 6(1): 59–64.

Sapkota, A. 2021. Enterobacteriaceae Cultural Characteristics. [online] >https://microbenotes. com/enterobacteriaceae-cultural-characteristics/#enterobacter-cloacae-on-nutrient-agar< [Accessed 14 Mei 2023].

Sapkota, A., 2022. Bacillus subtilis- An Overview and Applications. [online] > https://microbenotes.com/bacillus-subtilis/< [Accessed 17 Mei 2023].

Serdani, A.D., L.Q. Aini A.L. Abadi. 2018. Isolasi dan Identifikasi Bakteri Endofit dari Tanaman Padi (Oryza sativa) sebagai Pengendali Penyakit Hawar Daun Bakteri Akibat Xanthomonas oryzae pv. oryzae. Jurnal Viabel Pertanian. 12(1):.18–26.

Sudewi, S., A. Ala., Baharuddin dan M. Farid. 2020. The Isolation, Characterization Endophytic Bacteria from Roots of Local Rice Plant Kamba in, Central Sulawesi, Indonesia. Biodiversitas. 21(4): 1614–1624.

Warzatullisna., L. Fitri dan Y.S. Ismail. 2019. Potential of Endophytic Bacteria from Rice Root as Potassium Solvent. Biodiversitas, 20(5): 1303–1308.

Widiantini, F., E. Yulian dan D.S. Fiko. 2022. Penghambatan Pertumbuhan Rhizoctonia solani dan Penekanan Serangannya pada Perkecambahan Tanaman Padi oleh Bakteri Endofit Padi. Jurnal Fitopatologi Indonesia. 18(2): 75-84.

Woodley, C.L., dan H.L. David. 1976. Effect of Temperature on The Rate of The Transparent to Opaque Colony Type Transition in Mycobacterium avium. Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 9(1): 9–113.




DOI: https://doi.org/10.17969/jimfp.v8i4.27547

Refbacks

  • There are currently no refbacks.


 


JIM Agribisnis|JIM Agroteknologi|JIM Peternakan|JIM Teknologi Hasil Pertanian|JIM Teknik Pertanian|
JIM Ilmu Tanah|JIM Proteksi Tanaman|JIM Kehutanan


E-ISSN: 2614-6053 2615-2878 Statistic Indexing | Citation


Alamat Tim Redaksi:
Fakultas Pertanian,Universitas Syiah Kuala
Jl. Tgk. Hasan Krueng Kalee No. 3, Kopelma Darussalam,
Banda Aceh, 23111, Indonesia.
Email:jimfp@usk.ac.id