Skrining Potensi Senyawa Aktif Tumbuhan Sarang Semut (Myrmecodia Sp.) Sebagai Inhibitor Terhadap Reseptor α-Glucosidase Manusia Secara In Silico

Abstract

ABSTRAK

Diabetes melitus merupakan suatu penyakit yang ditandai dengan adanya gangguan pada metabolisme karbohidrat, lemak dan protein. Dari beberapa klarifikasi diabetes melitus, diabetes melitus tipe 2 merupakan tipe diabetes yang paling banya diderita. Penderita diabetes melitus perlu mengkonsumsi obat yang tidak menimbulkan efek samping yang berlebihan dalam jangka panjang. Salah satu obat alternatifnya adalah tumbuhan obat tradisional yaitu sarang semut. Sarang semut mengandung flavonoid, tanin, dan polifenol yang berpotensi sebagai obat antidiabetes melalui penekanan fungsi enzim α-glukosidase. Oleh karena itu penelitian ini bertujuan untuk melakukan skrining senyawa-senyawa di atas melalui uji in silico, untuk mengidentifikasi ketujuh senyawa aktif yang terkandung di dalam tumbuhan sarang semut dan mengidentifikasi senyawa yang memiliki kemampuan afinitas terkuat sebagai inhibitor enzim α-glucosidase. Struktur 3D senyawa aktif yang dikandung tumbuhan sarang semut (Myemecodia sp) yang diunduh berupa data “Canonical SMILES” dari PubChem dan dikonversi ke struktur 3D menggunakan “MOE builder software”. Metode in silico yang digunakan meliputi teknik “Homology Molecular dan Docking Molecuar”. Hasil analisa struktur hasil pemodelan human α-glucosidase diperoleh 88.59% asam amino masuk dalam core region Ramachandran Map, sehingga memenuhi syarat model dengan kualitas yang baik. Berdasarkan hasil skrining terhadap ketujuh senyawa aktif tumbuhan sarang semut menunjukkan adanya potensi sebagai inhibitor enzim α-glucosidase. Senyawa-senyawa yang berpotensi tersebut adalah α-tocopherol, kaempferol, luteolin, rutin, apigenin, iridoid dan quersetin. Untuk senyawa yang memiliki afinitas atau berpotensi kuat adalah senyawa luteolin dengan docking scores -15.88 kkal/mol. Dengan demikian semua senyawa aktif golongan fenolik tumbuhan sarang semut menunjukkan potensi sebagai inhibitor enzim α-glucosidase manusia dengan luteolin sebagai senyawa terkuat.

Kata kunci: Diabetes Mellitus, Myrmecodia sp, α-Glucosidase, Homology, Docking Molecular and Medicine Property

ABSTRACT

Diabetes mellitus is a disease characterized by disturbances in the metabolism of carbohydrates, fats and proteins. Based on literature, type 2 diabetes mellitus is the most common type of diabetes. Patients with diabetes mellitus need to take drugs that do not cause excessive side effects in the long term. One alternative medicine is traditional medicinal plants, namely Myrmecodia. _Myrmecodia contain flavonoids, tannins and polyphenols which have the potential as anti-diabetic drugs by suppressing the function of the α-glucosidase enzyme. Therefore this study aims to screen the above compounds through an in silico test, to identify the seven active compounds contained in the Myrmecodia  plant and identify the compounds that have the strongest affinity ability as inhibitors of the α-glucosidase enzyme. The 3D structure of the active compound contained in the Myrmecodia plant (Myemecodia sp) downloaded is “Canonical SMILES” data from PubChem and converted to a 3D structure using “MOE builder software”. The in silico method used includes the "Molecular Homology and Molecular Docking" techniques. The results of the structural analysis of human α-glucosidase modeling showed that 88.59% of the amino acids were included in the core region of the Ramachandran Map, thus fulfilling the model requirements with good quality. Based on the results of screening of the seven active compounds of Myrmecodia, they showed potential as inhibitors of the α-glucosidase enzyme. These potential compounds are α-tocopherol, kaempferol, luteolin, rutin, apigenin, iridoid and quercetin. Compounds that have a strong affinity or potential are luteolin compounds with a docking score of -15.88 kcal/mol. Thus all the active compounds of the Myrmecodia plant phenolic group showed potential as inhibitors of the human α-glucosidase enzyme with luteolin as the strongest compound.

Keyword: Diabetes Mellitus, Myrmecodia sp, α-Glucosidase, Homology, Docking Molecular and Medicine Property